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| 中国科学院副院长、中国科学院院士、中国科学院昆明动物研究所研究员张亚平课题组研究发现lincRNA基因的启动子、外显子和内含子甲基化水平均高于蛋白编码基因。揭示了蛋白编码基因和lincRNA基因在转录起始位点(TSS)及其附近区域有不同的甲基化模式。通过进一步研究发现,有很多lincRNA和差异甲基化区域(DMR)重叠,这些DMR鉴定于不同解剖部位、不同脂肪含量以及不同性别的不同品系的猪。研究发现一个lincRNA基因(linc-sscg3623)在民猪和大白猪的背膘组织(60天和120天)有不同的甲基化水平,在150天至180天、180天至210天两个发育阶段有去甲基化和再甲基化过程,提示linc-sscg3623基因可能与脂肪沉积调控相关。该研究有助于进一步理解lincRNA基因在家猪驯化过程中的作用。 该研究结果DNA methylation signatures of long intergenic noncoding RNAs in porcine adipose and muscle tissues 发表于Scientific Reports。博士研究生周中银为第一作者,张亚平、谢海兵以及中国农科院北京畜牧兽医研究所研究员王立贤为共同通讯作者。 |
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